
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱海洋生物 为其提供 TMT核蛋白组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
探索导致
设计拜谱生物研究时长推移冷冻冷冻冷藏时长廷长牛羊肉的洛氏强度、持水利、色度、存在铁浓度、ROS、脂质过空气氮化合物、MDA、GSH和GPX4程度来评估报告格式肌肉安排安排血细胞核的铁消失方式。结果展示展示,冷冻冷冻冷藏时长廷长后,牛羊肉的洛氏强度在第四天和第6天取得减低;持水程度变低;外表颜色变深,放弃光亮,鲜橙红成为暗橙红。不仅如此,存在铁、灵活性氧和MDA的浓度取得增强,血细胞核凋亡率取得提高。 研发者取出有距离 冷库精力的脂肪土样的高蛋清质,然后呢确定SDS-PAGE定性分折,高蛋清质条带在有距离 时段分散更加均匀且相同(图1a)。随着高蛋清在有距离 土样中的表达方式实际情况,定性分折察觉到同样组土样的中个数类似于同样级别(图1b),解释脂肪土样高蛋清质极具正常的组内相同性和组间距离性。 核脂肪酸组学共亲子判定结论出1996种核脂肪酸。以B0为相较比较组,建立B1、B2、B4和B6中的核血清做对比剖析表述剖析,共亲子判定结论到375个DEPs。将火山图信息可视化,并结合FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05的两个标淮剖析DEP。数据图甲1c-f如下,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中分刘海别亲子判定结论出22、33、73和140个DEPs,当中分刘海别调整6、11、32和85个,下跌16、22、41和55个。聚类分析最简单的方法鉴定了的不同冰箱步骤脂肪群组织安排中核脂肪酸的表述,数据显视脂肪群核血清表述对比剖析逐渐儲存用时的扩大而扩大(图1g)。
图1| 不相同冷冻箱事件的健身肌肉样板营养物质质组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 其他冷藏库事件的力量样机对比核蛋白进行分析(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁去世血清肽的PRM参考值研究分析(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 基本概念KEGG含有的差异表达出淀粉酶的铁意外死亡制度化(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱工作小结
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱生物技术提供了TMT一定量蛋清酶质组学科技工作,拜谱怪物已生产制造完成任务并组建了健全成熟期的转录组学、蛋清酶组学、分解组学已经多个学协力商品科技工作体系中,欢迎致电咨询!
考生医学文献:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.