
2023年4月2日,西班牙科尔多瓦大学Tomas Cerdo等人在Cell Host & Microbe(IF=30.3, 2023)杂志发表了题为“Infant gut microbiota contributes to cognitive performance in mice”的文章。研究人员使用16S rRNA测序、宏蛋清质组学和产生组学进行分析揭示了婴儿认识和肠道菌群之间的联系。结果显示认识能力较好的婴儿肠道菌群可以增强小鼠的记忆,并调节了小鼠外周血皮层(PRC)的组氨酸代谢组,这些结果表明“肠脑轴”在婴儿时期就起到至关重要的作用。
用英语版头:Infant gut microbiota contributes to cognitive performance in mice (Cell Host & Microbe,IF=30.3, 2023)
英文版主题词:婴儿肠道微生物群有助于小鼠的认知表现
组学枝术:16S rRNA+宏蛋白质组学+代谢组学
范本产品信息:婴儿粪便、小鼠粪便
研究分析一个构想
(图源:Tomas Cerdo, et al., Cell Host & Microbe. 2023)
最主要的探究结杲
01、幼儿交往本事和消化道菌群型式的内在联系
首先,研究人员基于贝利婴儿发育量表(BSID-III)数据,根据6个月大的婴儿在复合认识、语言和运动三个领域的得分,将婴儿分为高于中位数组和低于中位数组。通过对婴儿粪便样本进行16S rRNA分析,发现唯一与肠道微生物群落结构密切相关的BSID-III量表是复合认识(CC)。 与压低CC中五数字组(Inf-belowCC)的宝宝相较于,不低于CC中五数字组(Inf-aboveCC)的宝宝胃肠道菌群存在更强的平均性( 图1A)。在属水平上,Inf-aboveCC组的肠道菌群中杆菌、链球菌、拟副杆菌、严格感梭菌、霍氏杆菌和瘤胃球菌富集,而无毛螺科、嗜血杆菌和乳球菌的显著减少(图1B-D)。上述结果表明, 认识自己功能与众不同的幼儿,其肠子微生物发酵工程在群落结构设计构造上的存在显著性异同 。
图1. Inf-aboveCC和Inf-belowCC组宝贝胃肠菌好友分组成框架
02、小宝宝联系的能力关于的宏血清质组特殊性
为了探究与婴儿认识相关的肠道菌群功能特征,研究人员采用宏高蛋白质组学对婴儿粪便进行分析。结果表明,Inf-belowCC组的肠道菌群富含参与细胞内运输分泌和囊泡运输的蛋白质,而Inf-aboveCC组中参与碳水化合物运输和代谢的蛋白质有增加的趋势。稀疏偏最小二乘判别分析(sPLS-DA)图显示,婴儿宏蛋白质组(图2A)和促进区分的已鉴定蛋白质组(图2B)之间存在明显区别。组氨酸酶(HutH)是Inf-aboveCC宏白质组中主要明显含有的核膳食纤维。随后,研究人员通过DESEq2差异丰度分析(图2C)和Wilcoxon检验进一步证实了上述结果,组氨酸分解代谢的两种下游酶尿糖酸脱水酶(HutU)和咪唑酮丙酸酶(HutI)在Inf-above CC宏蛋白质组中丰度较高。上述分析结果揭示了与婴儿认识能力相关的宏蛋白质组特征。
图2. 宏球蛋白组学丰度解析
03、组氨酸细胞代谢与孩子判断特性特性关与
宏蛋白质组学数据和生化实验结果表明婴儿组氨酸代谢与认识能力相关,因此,研究人员开发一种靶向治疗代谢率组学方法用于定量分析组氨酸代谢物水平(图3A)。结果表明Inf-aboveCC组婴儿粪便中的尿酸盐水平显著降低,而其余组氨酸代谢物则无差异(图3B)。研究人员进一步检测了婴儿尿液中的组氨酸代谢物,结果显示与Inf-belowCC相比,Inf-aboveCC组婴儿尿液中组胺、组氨酸和尿酸水平显著升高(图3C),且Inf-aboveCC组粪便中的尿酸盐/组氨酸比值(图3D)和尿液中的组胺/尿酸盐比值(图3E)显著降低。粪便中的尿酸盐/组氨酸比值与unclass_lachnospirace_41和Lachnospiraceae incertae sedis属呈负相关,与Bacteroides_3呈正相关(图3F)。尿液中的组氨酸水平与Streptococcus_42和Bacteroides属呈正相关,而尿酸水平与Holdemanella_16呈负相关,与链球菌属呈正相关(图3G)。
图3. 组氨酸分解与宝贝的了解技能有关系
04、幼儿供体的胃肠道菌群小鼠移植成功
最后,为了调查肠道微生物群是否有助于认知,研究人员进行了一项粪便微生物群移植(FMT)实验。结果表明,将Inf-aboveCC供体的粪便移植到GF小鼠体内,其记忆功能优于Inf-belowCC供体的小鼠(图4)。被婴儿肠道菌群定植的小鼠拥有与记忆功能相关的不同细菌分类群,认知表现较好的婴儿微生物群小鼠表现出更高的记忆功能,包括Phocaeicola, Bacteroides和Bifidobacterium物种在内的丰富分类群以及不同的组氨酸代谢组学特征(图4B),其中,毛缕菌科和拟杆菌类与婴儿认知的关联在人源化小鼠中得到了复制。此外,与接受Inf-belowCC肠道微生物组的小鼠相比,认同Inf-below cc可以使肠胃微生物菌种技术组的小鼠HutH化学活化因此更为重要。总之,这些结果表明通过婴儿供体的肠道菌群粪便移植的记忆功能可以传播给GF小鼠,表明肠道菌群可以作为一种促进记忆的实体。
图4. 被小宝宝消化道菌群定植的小鼠拥有着与的记忆实用功能有关系的不一样病菌细分群
个人总结
上述情况,理论研究探讨师经由16S rRNA测序、宏核苷酸质组学和分解分解组学介绍成立了宝宝组氨酸分解分解组与了解期间的找,连接数现一个与把握学习特性一些的分解分解酶—组氨酸酶(HutH)。HutH关卡的的不同并且的不同的屎尿和他们的尿液组氨酸分解分解组与宝宝了解关干。不仅,经由宝宝供体的胃肠菌群屎尿胚胎种植的记忆特性效果也可以校园营销给无茵小鼠,把握学习特性很不错的宝宝供体胚胎种植小鼠所含Phocaeicola, Bacteroides和Bifidobacterium等与了解学习特性关干的疾病。理论研究探讨反映出宝宝和好了解和胃肠菌分组成期间的同步最旱在6八个月时就成立着了,组氨酸分解分解物关卡的调理是一种种因素的机理。拜谱总结ppt
本研究通过16S rRNA测序和宏球蛋白质含量组学分析使组氨酸酶在婴儿认识中的作用脱颖而出,并通过代谢组学和粪便移植的方法进一步验证,全面、明确论述了在新生新生宝宝-粪液人授小鼠保障体系中消化道菌群对感知技能的后果,为“肠脑轴”在新生新生宝宝一时期的發展和做用制度供应了新的掌握。拜谱生物作为一家国内领先的多组学服务公司,可提供蛋白质组学、代谢组学、修饰组学、16S rRNA测序等多组学技术,结合组学技术拜谱生物也推出了针对不同样本和研究领域的多组学研究方案,包括肠道篇、血液篇、医学篇等,帮助客户解决研究难题,助力多篇高分文章的发表,欢迎大家咨询!
参考选取论文参考文献:Tomas C, Alicia RR, Inmaculada A, et al. Infant gut microbiota contributes to cognitive performance in mice. Cell Host & Microbe. 2023, 31(12): 1974-1988. doi: 10.1016/j.chom.2023.11.004.