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新品发布|乳酸化的逆袭兄弟,衣康酸化修饰蛋白组强势来袭!

发布时间:2025-01-20

一直都为化工厂配料而被遵守的衣康酸(Itaconate,ITA),与乳酸从“排泄固体废物”变成 “宝箱小团伙”的苦不堪言心路历程相类似,陪你到近二十多年才被出现 其重点的菌物学功效,再也“坐起农奴把声乐”,比较是在天然免疫宫颈发炎性疫情实验范畴内异军突起。多余好几篇文章媒体报道了在各式各样宫颈发炎性疫情的小动物模式化中提供给衣康酸或其化学工业呈现衍菌物的治疗方法益处,并出现 其不确定性靶点。对衣康酸的“前生”与“今世”,详情文章《乳酸的逆袭之兄第——衣康酸!本文让你带着你了解衣康酸》。

拜谱生物正式推出基于化学蛋白质组学的衣康硝化作用表达蛋白质组学产品,实现1000+什么难以理解的度装饰位点查出,稳定性高再次出现径典靶点,全八卦方位生信分折解析靶点蛋白功能信息,发现新靶点,并提供从“看见”到“印证”全程序流程服务项目,为深度理解衣康酸及其衍生物在不同疾病研究中的作用机制提供重要依据。

PART 1

01、进行实验操作流程

02、测试数剧数剧

03、经“点”逆转

在测量统计数据中,排除两个医学文献中新闻报导的經典靶点简答衣康酸绘制位点,如第1 个被会发现的衣康酸共价绘制球核蛋白酶KEAP1,有糖酵解环路中的3个要素酶如LDHA、GAPDH、ALDOA,甚至炎性小体构造球核蛋白酶NLRP3和受损细胞细胞坏死历程中的要素球核蛋白酶RIPK3等,其质谱图相应图提示。

04、车辆特别

1.众多质控

商家化非特异聊天探头孵育、SDS-PAGE的检查、WB确认、子样本涉及性数据分析等各个位的检查,有效确保品牌数据安全性。

2.高功效质谱议器品台

在Orbitrap Astral全新一波的人高区分质谱仪火供下,完成衣康硝化作用修饰语位点及淀粉酶鉴定会新深入,推动科学有效研究分析新知道。

3.全环节一走式保障

通过拜谱生物技术更加完善的实验操作游戏平台,可提高“组织细胞养育→探头孵育→WB论文探测→艰深度衣康硝化作用表达论文探测→专业生信深入分析→既定位点PRM手机验证”全工艺流程产品,省时省钱更放心。

05、进行分析东西(环节)

06、利用目标

PART 2、文章手机分享

学术论文一

因为子标题:Chemoproteomic profiling of itaconation by bioorthogonal probes in inflammatory macrophages(Journal of the American Chemical Society,Q1,2020)

简体中文题头:炎症巨噬细胞中生物正交探针的化学蛋白质组学分析

研究分析介绍:本研究首次报道了基于衣康酸类似物OI,设计合成了适用于活细胞标记的衣康酸生物正交探针(ITALK),并实现了对炎症巨噬细胞中衣康酸修饰位点的直接鉴定。共鉴定出862个衣康酸化蛋白、1131个半胱氨酸位点,且存在18个赖氨酸和8个组氨酸的衣康酸修饰。这些修饰底物中包括了许多参与到炎症免疫响应和宿主防御相关调节通路中的关键蛋白,例如炎性小体、信号转导、转录和细胞死亡相关蛋白,暗示衣康酸可通过调节多种通路来影响巨噬细胞功能。作者们选取了几个新发现的修饰蛋白BRI3B、WIPI3和RIPK3并通过点突变实验对其修饰位点进行了验证。本研究为理解衣康酸在巨噬细胞炎症反应中的作用机制提供了丰富的数据支持。

(图源:Qin, Wei et al.,J Am Chem Soc. 2020)

参考文献二

日语标题文字:4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation(Cell Reports,Q1,2023)

常常微信标题:4-辛基衣康酸通过阻断STING蛋白棕榈酰化来抑制其活性

探究资源:cGAS-STING轴在防御外来病原体和维持免疫稳态中起着至关重要的作用。虽然在了解巨噬细胞活化过程中发生的代谢变化方面已经取得了实质性的进展,但对这些代谢变化如何影响cGAS-STING轴却知之甚少。在这项研究中,作者确定衣康酸的衍生物4-辛基衣康酸(4-OI)抑制cGAS-STING的激活。此外,作者发现4-OI抑制cGAS-STING相关的抗病毒免疫反应和自身免疫性炎症。然而,作者发现内源性衣康酸不影响cGAS-STING激活,表明4-OI和衣康酸的功能不同。从机理上讲,研究发现4-OI直接烷基化STING上的Cys91,阻断STING棕榈酰化和寡聚化。4-OI对STING的烷基化代表了STING的另一种翻译后修饰(PTMs)。该研究的发现揭示了cGAS-STING功能通过4-OI烷基化进行调节的机制,并为不同类型PTMs之间的串扰提供了见解。

(图源:Su, Chaofei et al.,Cell Rep. 2023)

PART 3、拜谱生物具象化设想

蛋白质的S-脂酰化(S-acylation)是指脂肪酸与半胱氨酸的巯基通过硫酯键相连。最典型的是棕榈酸,即S-棕榈酰化。催化这一反应的酶属于蛋白质酰基转移酶(protein acyltransferase,PAT)家族,含有DHHC(Asp-His-His-Cys)序列,所以称为DHHC-PAT。由于DHHC基序形成锌指结构域,因此编码这些酶的基因称为含锌指DHHC(zDHHC)。现已发现24种人类zDHHC基因,命名为zDHHC1- 24(无zDHHC10,有zDHHC11B)。这些zDHHC之间的底物亲和力和催化活性差异很大,其中zDHHC17和zDHHC13存在很强的底物结合起来学习能力,而zDHHC3和zDHHC7具有高效的S-酰化作用。

S-棕榈酰化通过两步机制进行(如下图)。第一步是DHHC基序中的半胱氨酸残基被来自棕榈酰-CoA的棕榈酸酰化,形成酰基酶中间体,这一步通常称为自棕榈酰化。第二步是将棕榈酰基部分转移到蛋白质底物中的半胱氨酸巯基上。

(图源:Anderson, Alison M et al.,NPJ Breast Cancer. 2016)

值得一提的是,在拜谱生物体衣康酸性反应掩盖组测试数据源数据源中,发现zDHHC13有3个半胱氨酸残基被衣康过酸修饰语(下面图)。不妨设想,zDHHC13的半胱氨酸残基被衣康酸烷基化,影响其自棕榈酰化,进一步影响其靶蛋白的棕榈酰化,进而影响相应的生物学功能,为相关机制机理研究提供新思路。

PART 4、拜谱工作小结

最为TCA巡环中的期间基础细胞代谢转化物,衣康酸调理基础细胞代谢转化、免疫系统抗体细胞和宫颈炎症病变之前的互不角色,为诊疗免疫系统抗体细胞宫颈炎症病变性消化道消化道疾病带来了代替品诊疗策略性。衣康酸设备构造类型中的亲电性α,β-不过饱和羧酸设备构造类型能对血清质上的活性氧半胱氨酸残基去烷基化淡化(迈克尔加持发生反应),此种翻译资料后淡化被喻为“衣康酸淡化(itaconation)”,而能导致血清质功能键,改善免疫系统抗体细胞对答和基础细胞代谢转化途经,为多重消化道消化道疾病用药产品研发带来新策略。

拜谱生物作为国内领先的多组学公司,全新推出基于化学蛋白质组学的衣康碱化淡化核蛋白组学产品,在全流程高精密仪器和高特异性生物正交探针加持下,可实现高精度、高深度的一站式衣康酸化修饰组检测。另外,可搭配拜谱生物医学研究可以说 酶联免疫法靶向疗法分泌组(QMT1000)或体力细胞细胞代谢靶向疗法细胞细胞代谢组软件对衣康酸及其类似物进行靶向绝对定量检测。多组学强强联手,有助于深入理解衣康酸化修饰的功能及其调控机制,为疾病机制机理研究提供科学依据,从而在指导靶向药物设计、疾病治疗等方面创造无限可能。欢迎咨询!

考虑论文文献

1. Qin W,Zhang Y,Tang H, et al. Chemoproteomic Profiling of Itaconation by Bioorthogonal Probes in Inflammatory Macrophages. J Am Chem Soc. 2020;142 (25):10894-10898. 2. Su C,Cheng T,Huang J, et al. 4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation. Cell Rep. 2023;42 (9):113040. 3. Anderson AM,Ragan MA. Palmitoylation: a protein S -acylation with implications for breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2016;2:16028.
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